目前氢能发展面临着不少障碍。首先是制取成本高，像电解水制氢，消耗大量电能，成本是传统化石能源制氢的数倍。
储存和运输也很麻烦。氢气密度低，要高压或低温储存，这对储存设备要求极高，成本也跟着飙升。而且氢气易燃易爆，运输过程中稍有不慎就可能引发危险。
基础设施建设也严重滞后。加氢站数量稀少，建一个加氢站成本高达上千万元，回本周期长，企业投资积极性不高。没有完善的基础设施，氢能车等应用就难以推广。所以，要想让氢能大规模发展，这些问题都亟待解决。