日韩关系改善面临着诸多挑战。历史问题是绕不开的坎，日本曾对韩国进行殖民统治，像慰安妇、劳工赔偿等问题一直是韩方心中的刺，即便首脑会谈有缓和迹象，但这些历史伤痛难以轻易抚平。
现实利益方面，两国在经济、领土等领域存在竞争。比如在半导体等产业上，双方有直接的利益冲突。而且美国“西半球优先战略”虽促使两国走近，但也带来不确定性，美国减少对东亚关注后，日韩在安全等方面的合作可能受影响。另外，国内民意也是挑战，韩国民众对日本的历史行径仍有不满，政府改善关系可能面临国内压力。