原来黄石公园的湖水可以取人性命。70年代,有个男人的狗掉进了黄石公园湖水中,男人跳进了河里。他在河里游了大约一分钟,导致全身神经末梢受损,双目失明。他后来游回了岸边,被人救出水面后用直升机送往盐湖城,大约一天后去世了。现在黄石公园已经禁止带狗了。很多地方甚至有严格限制或禁止,进入某些水域可能对身体有害,甚至致命。
公园内大多数河流和湖泊水温很低,即使夏天也接近冰点,容易导致冷水休克、肌肉痉挛、快速体力耗尽甚至溺水。溺水是黄石公园死亡原因的第一位。
公园地热活动强烈,很多地方水下有沸腾的热泉,可达近100°C。踩破薄地壳或掉进去会造成严重烫伤甚至死亡。
以前有混合冷热水区可以浸泡游泳,但2022年洪水后已关闭,目前无法进入。以前也有警告:热水中可能有导致皮肤感染、阿米巴脑膜炎(可致命)等病菌,不要把头浸入或吸入蒸汽。
热泉区域绝对禁止进入,有围栏和警告标志。违反会罚款,还可能致命。

