南京大学是华东五校之一，综合实力稳居全国前十。不过从学科来看，南京大学排在全国前列的基本都算不上热门，譬如7个前2或前3%学科分别是天文学、大气科学、信息资源管理、物理学、环境科学与工程、中国语言文学和外国语言文学，其中除了物理学作为基础学科外，其余包括天文、大气、环境科学与工程等学科总体来说都是偏冷门学科，这意味着南京大学的强势学科中，热门学科数量确实太少了些，也无怪乎总是被武汉大学、华中科技大学等高校拿来做对比的对象。