1949年，蒋介石：“何应钦，没杀他，已经是我对他最大的恩典了。”何应钦本来想去美国，可蒋介石让他必须来台，否则后果自负。何应钦知道蒋介石的手段，只有去到台湾。
在国民党军政系统里干了几十年，从军政部长、参谋总长，一直做到国防部长、行政院长。官做到这个地步，该经历的风浪几乎都经历过。更重要的是，到了1949年，他已经看得很明白：大陆战局大势难挽，继续站在台前，不但没有多少实权，出了问题还要承担责任。
所以，从行政院长的位置退下来以后，何应钦确实有远离政治中心的打算。
可他想退，蒋介石未必允许他退。
1949年的国民党高层，有一个很特殊的局面。
1月21日，蒋介石宣布下野，由李宗仁代行总统职权。表面上看，南京换了主持局面的人，可军队、人事、财政以及国民党内部的重要关系，并没有随着蒋介石离开南京而一下子转到李宗仁手中。
李宗仁想推动和谈，也想重新安排军政班子，可许多高级将领仍然看蒋介石的态度。
这就出现了一个麻烦：谁来当行政院长？
这个人既不能完全倒向李宗仁，也不能让蒋介石觉得不可靠；既得压得住场面，又得有足够资历。挑来挑去，何应钦被推到了前台。
3月12日，李宗仁提名何应钦组阁。到了3月下旬，何应钦正式接掌行政院，同时仍处在军事事务的中心位置。
这并不是一次值得羡慕的升官。
恰恰相反，这是何应钦政治生涯中最难受的一段时间。
李宗仁是名义上的最高负责人，蒋介石却仍然拥有巨大影响力。何应钦每天面对的事情，几乎都绕不开两边。李宗仁希望行政院配合自己的政策，蒋介石又有自己的军事安排。
何应钦夹在中间，哪一边都不能轻易得罪。
更麻烦的是，战场没有给他多少时间。
4月，国共和谈没有取得结果，人民解放军渡过长江。南京很快解放，国民党军政机关南撤广州。短短一个多月，何应钦这个行政院长已经从南京做到广州，手里的局面却越来越小。
到了5月，他已经无力改变整个战场形势。
5月20日，何应钦提出辞去本兼各职。5月30日，何应钦内阁全体总辞。直到6月13日阎锡山正式接任，这场只有两个多月的行政院长经历才算彻底结束。
表面上看，何应钦终于脱身了。
实际上，他真正的麻烦才刚开始。
何应钦和蒋介石认识太久了。
两个人从黄埔时期一路走来，合作时间很长，但绝不是几十年始终亲密无间。蒋介石用何应钦，是因为何资格老、军中关系深、办事能力强；何应钦依靠蒋介石，也因为离开蒋的政治体系，他很难长期站在权力中心。
这种关系里，有合作，也一直有戒心。
最典型的一次，就是1936年的西安事变。
蒋介石被张学良、杨虎城扣留后，南京内部出现不同意见。宋子文、宋美龄等人更倾向于设法和平解决，何应钦却主张采取军事行动。
12月16日，何应钦被任命为“讨逆军总司令”，中央军随后向西安方向施压，飞机也对西安附近地区采取军事行动。
这件事后来成为蒋何关系中很难完全消失的一层阴影。
原因并不复杂。
蒋介石人在西安，如果南京方面大举进攻，局势一旦失控，他本人首先就可能遇到危险。何应钦当时究竟更多出于维护南京军政体系，还是另有政治考虑，后世有过各种分析，但有一点很清楚：蒋介石此后对何应钦并没有毫无保留地信任。
只是何应钦在军中的资历太深，许多时候仍然离不开他。
于是，两个人形成了一种很微妙的状态。
需要何应钦的时候，仍然把重要位置交给他；真正涉及最高权力时，又不会让他掌握完全独立的力量。
到了1949年，这种关系再次显现出来。
何应钦已经辞去行政院长，按他的想法，最省事的办法就是退出政坛。况且他此前在美国工作过，对当地并不陌生。离开东亚的政治风暴，做一个不问政事的寓公，对他而言完全可以理解。
然而，此时的蒋介石最担心的，恰恰就是国民党高级将领各奔东西。
大陆战局迅速变化，大批军政人员正在寻找自己的退路。有人去香港，有人准备出国，也有人与蒋介石渐行渐远。
蒋需要把还能够利用的高级将领尽量留住。
何应钦显然属于这一类。
他不仅当过国防部长、参谋总长和陆军总司令，在黄埔系以及旧国民党军队中还有相当高的辈分。如果这样一个人物公开前往美国长期生活，对当时已经十分困难的蒋介石而言，无论从政治影响还是军心层面，都不是愿意看到的结果。
也正是在这样的背景下，后来留下了标题中那句很重的话：“何应钦，没杀他，已经是我对他最大的恩典了。”
何应钦听不听得进去其他人的劝告并不重要，他最清楚蒋介石是什么脾气。
几十年的共事，让他明白一件事情：这个时候公开违背蒋的要求，对自己没有任何好处。
于是，原先准备远走美国的计划只能放下。
1949年夏天，何应钦一度停留香港。到了8月，他最终前往台湾地区。
这一步走出去，他后半生的政治位置基本也就定了。
到了台湾地区后，何应钦没有重新回到过去那种掌握军政实权的位置。1950年，他出任战略顾问系统的重要职务。名字听起来仍然很高，实际作用却已经与他早年担任军政部长、参谋总长时不可同日而语。